SURPASS, czyli jak zbudować białko z klocków

Fizyka Medyczna - Farmacja Fizyczna 2022

Białka to mikro-roboty, które codziennie walczą o nasze zdrowie. Już w starożytności znano substancje, które wspomagają ich prace, a dziś umiemy je nawet zaprojektować. W tym celu potrzebujemy znać strukturę przestrzenną białka, na które ma działać dana substancja, na przykład lek. Niestety nie wszystkie białka mają znaną strukturę. W związku z tym prowadzi się symulacje komputerowe, które prowadzą do obliczenia prawdopodobnej konformacji białka. Istniejące obecnie programy w miarę dobrze radzą sobie z obliczaniem struktur dla małych i prostych cząsteczek. Problem zaczyna się, gdy układ białkowy jest wieloelementowy i przez to złożony. Obliczanie takiej struktury zajmuje często nawet pare tygodni, a zdarza się, że obliczenia nie przynoszą oczekiwanych rezultatów. SURPASS jest narzędziem, które korzysta z uproszczonej reprezentacji białek. Dzięki temu program potrafi przewidzieć strukturę nawet skomplikowanych układów białkowych. Dodatkowo czas obliczania takiej struktury udaje się skrócić nawet do paru dni. Otwiera to możliwości na modelowanie również białek wielodomenowych oraz kompleksów białkowych.

Justyna Kryś

 Info

Date
20-05-2022 12:25
Duration
15 minut
Location